岩永哲哉

　　某日，小新（矢岛晶子 配音）、小葵和美伢（楢桥美纪 配音）被一群神秘人物绑架，醒来之后发现身处一间神秘的基地之内，原来，这里是名为“温泉G组”的秘密组织，意在保护对于日本来说十分珍贵的温泉。然而，

　　突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV

　　

　　抱持着帮助他人而化身魔法少女，与此同时却必须背负着残酷的命运。在接二连三的战斗中，善良的美树沙耶加（喜多村英梨 配音）彻底耗尽自己的生命。当她的尸体被晓美焰（斋藤千和 配音）和佐仓杏子（野中蓝 配

　　松井贵博（山口胜平 配音）第一次看到冢本裕司（古泽彻 配音）是在游泳比赛中，天真的松井立刻就被裕司帅气的身姿所吸引从而深深迷恋上了他。可是松井不知道的是，在裕司健康爽朗的外表下，藏着一颗由于被压迫

　　13岁的少年刘昴星（田中真弓 配音）在料理方面具有极高的天赋，自从母亲去世后，他和姐姐合力经营菊下楼，过着平静自在的生活。然而一个不速之客打破了这一切，母亲的徒弟绍安意图霸占酒楼，经过一番料理对决

　　「俺はあなたが好きだ！」「僕も君が好きだよ」しかし、同じ気持ち過ぎるからうまくいかない恋もある。相手を受け入れるのではなく、性格的に攻め込みたい緒方×高杉。けれど、心がウルウルと幸せを欲しがって、

　　东京大街上的一角，某栋高楼的顶层废弃小屋中。町屋翔太正在制作梦想中的火炬，而他的朋友绫瀬明日奈的父亲的尸体，出现在了这座大厦。警察的调查没有什么结果。但第2天一位白发少女给翔太送来了明日奈的父亲写

成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。